Описание: В будущем мире, в Нео-Домино началась новая эра дуэлей. Дуэли переросли в скоростные дуэли, в которых дуэлисты сражаются друг против друга на своих мотоциклах, называемых Ди-Виилами.
Нового главного героя зовут Юсей. В начале арки, Юсей попытается уехать из города Сатейлайт в Нео-Домино, потому что его бывший друг, Джек, украл у него дорогую ему карту и его Ди-Виил. После того, как Юсей попадет в город, его арестовывает Охрана и отправляет в исправительные центр. Там он находит новых друзей, и узнает секрет о врожденной метки дракона, что находится у него на руке, и еще, что есть четыре других человека, имеющих такие же метки. Их называют пятью Избранными. Чтобы узнать личности остальных Избранных, организован "Кубок Фортуны".
Настоящие приключения пяти Избранных начались как только все их личности были раскрыты в "Кубке Фортуны". Настоящий враг, что находится в тени, готовый противостоять пяти Избранным. Битва 5,000 летней давности, происходившая между Избранными и Тёмными Избранными, вновь начинается, и на кону находится судьба целого мира.
Описание: Прошло 6 месяцев после битвы с Тёмными Избранными. Сателайт и главный город теперь соединены и нет никакой дискриминации. Юсей, Джек и Кроу мирно живут и работают каждый день, готовясь к грядущему "Всемирному Скоростному Гран-при, который организовывает Нео-Домино. В то же время, новая угроза, исходящая от группы "Илиастер", приближается к ним.
Арка Колыбели является четвёртым и последним сезоном. Этот сезон начинается после последнего матча Всемирно Скоростного Гран-При, где команда 5Д выиграла последнюю дуэль против команды Новый Мир. Предполагалось, что это остановит Арку Колыбели от падения её на Город Нео Домино. Однако, матч закончился и с этим ВСГП, но Арка всё равно появилась. Команда 5Д в неё внедряется чтобы помешать Зону воплотить свои планы в жизнь. А также, в конце концов, главные герои должны будут решить, что они собираются делать в будущем, как жить... На этом и заканчивается аниме сериал «Yu-Gi-Oh! 5D’s».